循环水处理中由于养分的浓缩，水温的升高和夏季长时间的日照，给细菌和藻类创造了迅速繁殖的条件。大量细菌分泌出的黏液合剂一样，能使水中飘浮的灰尘杂质和化学沉淀物等黏结在一起，形成粘糊糊的沉积物一生物污淤附在主机冷凝器的传热表面上（及冷却塔的换热填料中），除引起垢下腐蚀外，还使循环水的流量减少，降低热交换效率，增大耗电量及主机负荷，严重时还会堵塞管道。

针对菌藻的危害性，交替投加不同类型的2种系列杀菌灭藻剂抑菌清洗剂，这些杀菌剂对各种细菌、藻类具有广谱杀灭性对有针对性，降低酸性含氮化合物的形成；每月或二十天清洗一次冷却塔，使细菌总数＜105个/ml>。 通常，在有效地控制循环水的腐蚀、结垢及生物粘泥等危害的前提下，就尽可能在较高浓缩倍数下运行，从而获得最大限度的节约用水和最佳的水处理经济效益。冷却循环水的补充水源是自来水，自来水水质属于中等硬度、低碱度水质，有一定结垢倾向和较强腐蚀性。在水的循环过程中，冷却水蒸发引起浓缩。当浓缩倍数增大至7倍以内，排污水量和补充水量迅速下降，节水效果明显，但浓缩倍数提高，水的结垢增强，因此需采用阻垢剂防止结垢。